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2024-09-13

亚热带国家重点实验室夏瑞教授团队发表基因结构注释矫正工具——SynGAP

　　近日，亚热带农业资源保护与利用国家重点实验室夏瑞团队在Genome Biology（影响因子10.1）上在线发表了题为“SynGAP: a synteny-based toolkit for gene structure annotation polishing”的研究论文。该研究开发了一种基于基因共线性进行物种基因组基因结构注释矫正的工具SynGAP（Synteny-based Gene structure Annotation Polisher）。该工具基于近缘物种基因共线性，去鉴定并矫正原始基因结构注释中的潜在错漏，实现基因结构注释的优化。　　演化过程中，在具有共同祖先的近缘物种之间，染色体上同源基因存在保守排列的现象，被称为基因共线性（gene synteny）。近缘物种的基因共线性区块中，部分基因丢失了与其对应的共线性基因，进而在区块内形成共线性对的间隔（gap，图1a）。共线性基因的缺失，可能由基因组序列的变化引起的，同时还有可能是错误注释或缺失的基因模型（mis-annotated or absent gene models，MAGs）导致的。基于后一种可能性，作者们
2024-09-13

数学与信息学院、软件学院本科生以第一作者身份在国际知名期刊发表学术论文

　　近日，AG真人数学与信息学院、软件学院2021级本科生黎倩尔以第一作者身份在人工智能领域知名期刊Engineering Applications of Artificial Intelligence（影响因子7.5）发表了题为“Generating and Encouraging: An Effective Framework for Solving Class Imbalance in Multimodal Conversational Emotion Recognition”的学术论文。　　近年来，智能个人助理（Intelligent Personal Assistants, IPAs）已成为人机交互的重要工具，具有广泛的应用，如语音助手、虚拟客服和导航等。捕捉并理解用户的突出情感需求对于提高IPA的服务质量至关重要。多模态的对话情绪识别是构建IPAs的关键，引起了越来越多的关注。该领域的先进技术是基于图模拟跨模态和单模态交互，然而这些方法忽略了对话情绪类别高度不平衡的问题，无法对少数类的情绪类别进行有效识别。目前数据挖掘的研究采用过采样的方法解决类不平衡分类。然而，它们并不适合直
2024-09-11

齐龙研究员团队在农业机器视觉研究取得新进展

　　近期，齐龙研究员团队在IEEE Transactions on Image Processing（CCF A类期刊、中科院一区Top，影响因子10.8）、Smart Agricultural Technology（JCR 1区，影响因子6.3）、Computers and Electronics in Agriculture（中科院一区Top，影响因子7.7）等刊物上发表了农业机器视觉研究的新成果，在水田杂草精准识别和视觉导航方面取得了新突破。频域+Attention的水田杂草精准辨识网络　　团队在国际著名刊物IEEE Transactions on Image Processing上发表题为“Learning Attention in the Frequency Domain for Flexible Real Photograph Denoising”的研究论文。该论文联合澳门大学及湖南大学共同完成。工程学院马锐军老师为第一作者，水利与土木工程学院齐龙研究员和澳门大学张一博副教授为共同通讯作者。　　现有基于自注意力、通道/空间注意力的深度学习模型，在非结构化水田环境下难以提取具
2024-09-09

动物科学学院吴珍芳教授团队通过跨物种比较研究揭示胎盘发育新机制

　　近日，AG真人国家生猪种业工程技术研究中心/猪禽种业全国重点实验室吴珍芳教授团队在国际著名期刊Advanced Science发表题为“Cross-Species Insights into Trophoblast Invasion During Placentation Governed by Immune-Featured by Immune-Featured Trophoblast Cells”的研究论文，并被选为Frontispiece（扉页论文）高亮推荐。该研究通过对猪、鼠和人等物种胎盘发育机制的深入比较，系统解析了不同物种胎盘细胞组分变化及基因时空表达规律，发现了一类具有免疫特征的新型滋养层细胞（iTrophoblast），并揭示了其在调控滋养层细胞侵袭、保障胎盘发育中的重要作用。　　胎盘是哺乳动物妊娠过程中连接母体和胎儿的重要器官，胎儿生长发育所需营养物质都需要通过胎盘从母体获取。根据胎盘滋养层细胞侵袭性及其与母体子宫内膜的融合程度，哺乳动物胎盘可分为上皮绒毛膜胎盘、结缔绒毛膜胎盘、内皮绒毛膜胎盘和血绒毛膜胎盘4种类型。猪胎盘是典型的上皮绒毛膜胎盘，分娩时胎盘容易与子宫脱
2024-09-05

文晓巍团队在Journal of environmental management发表研究论文

　　近日，文晓巍团队在中科院二区Top期刊Journal of environmental management上在线发表了题为“Impact of agricultural product brands and agricultural industry agglomeration on agricultural carbon emissions”的研究成果。　　研究利用2008-2021年中国30个省份的面板数据，考察农产品品牌对农业碳排放的影响及内在作用机制。结果表明：（1）农产品品牌有助于降低本地区农业碳排放强度，而且对邻近地区农业碳排放强度具有负向溢出效应。（2）农产品品牌能够通过提升农业产业集聚水平减弱农业碳排放强度。（3）农业规模经营水平在农产品品牌与农业碳排放强度之间存在双重门槛效应，且阈值区间的提高增强了农产品品牌的减排效应。研究结论能够为发挥农产品品牌建设优势以推动农业碳减排提供有益启示。　　论文第一作者为AG真人游戏平台经济管理学院博士生张思慧，通讯作者为广东农村政策研究中心文晓巍教授。　　相关论文链接：https://authors.elsevier.com/c/1
2024-09-03

徐汉虹/张志祥教授团队在农药新剂型创制与应用方面取得新进展

　　近期，植物保护学院/绿色农药全国重点实验室徐汉虹/张志祥教授团队，在ACS Nano (1区，影响因子15.8)、Journal of Hazardous Materials (1区，影响因子12.2)、Science of the Total Environment (1区，影响因子8.2)和International Journal of Biological Macromolecules (1区，影响因子7.7)等国际著名期刊上，发表了农药新剂型制备技术和创新应用的研究新成果，在农药靶向传递和非靶标生物安全性研究方面取得了新突破。针对有害生物的为害特点，设计制备了多种绿色环保纳米农药新剂型，开发出系列农药精准靶向施药技术，研究了对蜜蜂、蚯蚓和斑马鱼等非靶标生物的影响，系统性评估了生态安全性。暴露于不同类型的金属有机框架纳米粒子对成年斑马鱼肠道微生物群和肝脏代谢的影响　　团队在国际著名刊物ACS Nano上发表题为“Effects of Exposure to Different Types of Metal–Organic Framework Nanoparticles on
2024-09-03

亚热带国家重点实验室夏瑞教授团队揭示PEBP家族FT基因的多样性致无患子科植物开花性状变异的潜在机制

　　近日，亚热带农业资源保护与利用国家重点实验室、AG真人游戏平台夏瑞团队在Molecular Horticulture （影响因子10.6）上在线发表题为“Diversification of FT-like genes in the PEBP family contributes to the variation of flowering traits in Sapindaceae species”的研究论文。该研究利用无患子科植物的基因组（Li et al. 2024）和大量转录组数据分析结合实验验证，揭示了无患子科植物FT基因编码区和启动子区的变异可能是导致无患子科植物开花性状变异的潜在机制。　　FT 基因是PEBP家族成员，其编码的成花素在植物中起着重要的调控作用。根据团队前期发表的47份荔枝种质的重测序数据（Hu et al. 2022），发现LcFT1启动子区域中存在一个含有单核苷酸多态性（SNP）的CArG-box。在该SNP位点（位于LcFT1ATG上游的1,437个核苷酸处），几乎所有极早熟荔枝品种（EEM）都含有G等位基因，早熟品种（EM）有两种基因型（R表示杂合G/
2024-09-03

海洋学院邹记兴/周爱国团队2篇论文入选ESI高被引论文

　　近日，AG真人海洋学院水产育种与健康养殖团队邹记兴/周爱国课题组在REVIEWS IN AQUACULTURE（中科院1区Top，影响因子11）、JOURNAL OF HAZARDOUS MATERIALS（中科院1区Top，影响因子11.9）期刊上发表研究论文“Microplastics and their potential effects on the aquaculture systems: a critical review”和“Interactions of microplastics and antibiotic resistance genes and their effects on the aquaculture environments”相继入选ESI高被引论文。　　论文紧紧围绕环境新兴污染物和水产养殖的关系为突破口，全面系统阐述了全球水产养殖概况以及新兴污染物对水产养殖的潜在影响，新兴污染物之间的互作关系及其复合污染在水产养殖环境的联合毒理效应等。综合论述了复合污染物的形成及其通过食物链进入水生生物，并在长期富集后最终进入人体的内在机制，最终对人类健康和生态环境
2024-08-30

药用植物研究中心吴鸿团队在Industrial and Crops Products发表研究论文

　　近日，生命科学学院药用植物研究中心吴鸿教授团队在农学一区Top期刊Industrial Crops Products（2023IF：5.6）在线发表题为“A comparative analysis of the composition of the primary bioactive molecules, antioxidant activities, and anti-inflammation abilities of the roots of Zanthoxylum nitidumharvested at different years of cultivation”的研究论文。该研究基于生物活性成分积累、体外抗氧化活性和体内抗炎功效等对不同年生的两面针药用部位根进行综合评价，为两面针药材适时采收和质量控制提供了成分和药效参考数据。　　对于多年生药用植物，生长年份的不同不仅影响其生物量，更影响其药材的化学成分积累与临床疗效。因此，药用植物的适时采收对于保彰药材质量和药效成分含量至关重要。两面针（Zanthoxylum nitidum(Roxb.) DC.）作为重要的传统南药
2024-08-30

庄楚雄/郑少燕团队揭示水稻叶片衰老的表观遗传调控机制

　　近日，生命科学学院庄楚雄/郑少燕团队在中科院一区TOP期刊Journal of Integrative Plant Biology上发表了题为“The OsAGO2–OsNAC300–OsNAPmodule regulates leaf senescence in rice”的论文，揭示了水稻AGO2蛋白和小RNA在水稻叶片衰老过程中的作用，为水稻的抗衰老育种提供了新思路和策略。　　水稻作为世界重要的粮食作物及功能基因组研究的模式植物，与人类的生活息息相关。提高水稻产量一直是水稻研究的重要目标。叶片作为植物光合作用的主要场所，其光合产物作用于植物生长发育过程中。叶片衰老是植物一个重要的发育阶段，非适时的衰老将严重影响作物的产量。Argonaute（AGO）蛋白是表观遗传调控的主要执行者之一，为RNA诱导的沉默复合体（RNA-induced silencing complex, RISC）的关键组分。AGO蛋白可以被小的非编码RNA（non-coding small RNA, sRNA）引导到特定的靶位点，通过碱基配对的方式，参与靶mRNA的切割或招募其他辅助因子介导基因沉默的DNA
2024-08-30

生命科学学院邓诣群教授团队揭示UPF3B与IRE1α互作调节细胞内质网应激的新机制

近日，生命科学学院邓诣群教授团队在生物学一区TOP期刊《Cell Death Disease》在线发表题为“UPF3B modulates endoplasmic reticulum stress through interaction with inositol-requiring enzyme-1α”的研究论文，该研究发现UPF3B与IRE1α互作抑制细胞内质网应激，揭示了无义介导的mRNA衰变(NMD)在细胞应激响应中的新型调控机制。细胞在毒素、药物和缺氧等应激因素刺激下，会通过多种响应外界变化的应激型适应性模式，改变细胞内稳态，调节自身的存活或死亡，以适应外界压力。内质网应激是一种重要的细胞应激方式，通过诱导未折叠蛋白反应（UPR）以缓解应激状态，维系细胞内稳态。IRE1是重要的内质网应激传感器。NMD可以快速降解含有提前终止密码子的mRNA，在mRNA质量控制中发挥重要作用。NMD可以控制激活UPR所必需的细胞应激阈值，NMD本底活性可调节细胞应激反应，维持细胞稳态。然而，NMD在维持内质网稳态中的作用尚不清楚。　　作者前期发现呕吐毒素（DON）等外界刺激作用细胞时，会明显
2024-08-30

罗锡文院士/周志艳教授团队在农用无人飞机颗粒物料播撒方法方面取得新进展

近日，AG真人工程学院、农业装备技术全国重点实验室、岭南现代农业科学与技术广东省实验室、广东省农业人工智能重点实验室、南方农业机械与装备关键技术教育部重点实验室和广东省农业航空应用工程技术研究中心罗锡文院士/周志艳教授团队获得农用无人飞机颗粒物料播撒方法方面的国家发明专利授权，并发表高水平期刊论文，相关研究成果在农业工程领域顶级期刊Computers and Electronics in Agriculture（中科院/SCI一区Top期刊，影响因子8.3）发表了题为“Distribution uniformity improvement methods of a large discharge rate disc spreader for UAV fertilizer application”的研究论文。作为国家农业航空产业技术创新战略联盟理事长和中国农业机械学会农业航空分会主任委员，罗锡文院士从2008年开始呼吁加快推进我国农业航空的发展。经过十余年的推动，农用无人飞机已成为我国农业生产中不可或缺的重要工具，是当前低空经济发展的重要新质生产力。但由于无人飞机的载荷量有限，且旋翼风场干扰
2024-08-30

王浩团队揭示拟南芥NBR1受体在选择性自噬中的双重功能与分子作用机制

　　近日，AG真人游戏平台生命科学学院王浩教授团队在《Autophagy》(2023 IF:14.6) 上发表题为“Dual roles of AtNBR1 in regulating selective autophagyvialiquid-liquid phase separation and recognition of non-ubiquitinated substrates in Arabidopsis”的研究论文，该研究揭示了植物中的NBR1在选择性自噬中的双重作用和在进化过程中其在植物与动物中的区别与联系。　　自噬是真核生物中主要的物质降解代谢途径之一，参与调控植物生长、发育和衰老等过程。动物中的NBR1和p62/SQSTM1是进化保守的选择性自噬受体，在自噬底物的特异性选择和识别过程中起着关键作用。NBR1和p62都可识别和结合底物蛋白，通过其LC3相互作用区(LIR)与LC3相互作用，介导被降解底物包被至自噬体中。但是p62还具有聚合和发生液-液相分离的独特功能，以提高被降解底物的聚集和自噬降解效率。但是，植物中缺乏p62蛋白而仅存NBR1，是什么蛋白质发挥了类似动物p6
2024-08-29

兽医药理学团队孙坚教授在耐药性传播领域取得新进展

　　近日，兽医学院、国家兽医微生物耐药性风险评估实验室、广东省兽药研制与安全评价重点实验室的孙坚教授在中科院医学一区期刊Drug Resistance Updates（影响因子18.1）和Materials Today Bio（影响因子8.8）上发表了两篇研究长文，分别题为“CRISPR-AMRtracker: a novel toolkit to monitor the antimicrobial resistance gene transfer in fecal microbiota” 和“Waterborne polyurethane nanoparticles incorporating linoleic acid as a potential strategy for controlling antibiotic resistance spread in the mammalian intestine” 。　　细菌耐药性导致的死亡人数不断增加，已对全球健康构成严重威胁。耐药基因能够在不同细菌之间水平转移，加速耐药性的传播，而哺乳动物的肠道则是耐药基因转移的主要场所之一。然而，

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